薬医門
豊臣秀吉の命により、豊臣秀頼が再建。
本堂（持仏堂）
本尊は大日如来（定朝作）。
旧本堂の本尊薬師如来の御身代仏である薬師如来（長勢作）。開祖弘法大師、開基理源大師、歴代住職位牌などの諸尊諸仏がまつられています。
観音堂
本尊は、十一面観世音菩薩（運慶作）。
脇侍は、毘沙門天、不動明王。
旧地蔵堂の本尊地蔵菩薩（聖徳太子作）。
その他諸仏がまつられています。
愛染堂・金毘羅殿
本尊は愛染明王。
恵美寿尊、牛頭天王、宇賀弁財天。
その他秘仏がまつられています。
奥には金毘羅殿があり、金毘羅大権現がまつられています。
宝篋印塔
和泉式部の写経が納められています。
